Монастырь был построен в XVII веке, однако в 1995 году переехал в новое здание постройки 1995 года. В историческом месте монастыря, где сохранился собор в честь Казанской иконы Божией Матери, с советских времен находится госархив. Здание храма не передано РПЦ. Сейчас монастырь расположен в здании бывшего Духовного училища с домовым храмом в честь свт. Гурия. В этом же здании находятся православная гимназия и женское епархиальное училище.
Казанский монастырь был основан в середние XVII века при царе Михаиле Феодоровиче Романове. Монастырские здания не раз перестраивались, в XIX веке на его территории была построена колокольня, а в начале XX века - величественный трехпрестольный собор в византийском стиле в честь Казанской иконы Божией Матери. В настоящее время в храме располагается госархив.
Монастырь был закрыт советской властью в 1918 году. На момент закрытия монастыря в нем проживало 118 монахинь и послушниц. Все постройки обители, кроме собора, пострадали от пожара при освобождении Калуги в 1941 и были разобраны.
Монастырь был возрожден в 1992 году на новом месте в виде монашеской общины. В монастыре хранятся святыни: ковчег с мощами святителя Гурия Казанского; иконы с мощами преподобного Серафима Саровского, преподобных Оптинских старцев и другие.