Храм Усекновения главы Иоанна Предтечи был воздвигнут в 1514 году на месте обветшавшей деревянной церкви Иоанно-Предтечинского монастыря. Есть основание утверждать, что это был первый храм в Замоскворечье построенный из камня. После упразднения монастыря в XVI веке, храм стал приходским. В разгар Смуты, храм Иоанна Предтечи был частично разрушен. Его заново выстроили только в 1658 году, от первозданного вида сохранились лишь белокаменные фрагменты в фундаментах и подклети храма. Новое одноглавое здание выстроено с элементами стиля барокко, который только начинал появляться в московской архитектуре. В первой четверти XVIII века упоминается о приделе святого Николая Мирликийского. Придел был построен у северной стены храма, со стороны Кремля. На южной стороне была устроена паперть, а со стороны Большой Ордынки - трапезная и колокольня. Храм закрывают в 1917 году, в этом году у храма сносят купол. Немногим позже в церкви разместили управление продовольственными товарами. В середине 1970-х годов, в связи с подготовкой к Олимпиаде-80, начинается масштабная реставрация памятников архитектуры в Москве. Был восстановлен портал вместе с оконными наличниками XVII века и колокольня. На храме вновь появляются купол и крест. В начале 90-х церковь передают верующим, богослужения возобновились в 1997 году.XVII