Троицкая церковь — старинный, намоленный храм, живописно расположенный высоко на горе над частным сектором города Томска. В советское время был одной из двух действующих церквей на весь полумиллионный город.
Храм изначально был единоверческим: его построили на деньги перешедшего в православие старообрядца Петра Ивановича Поздеева, а приход составляли единоверцы — старообрядцы, объединившиеся с православной церковью при сохранении старого обряда. В 1858 году в храме обустроили придел в честь священномученика Харалампия Магнезийского (в храме хранится частица его мощей), в 1876-1887-м был пристроен придел великомученика Димитрия Солунского.
После революции в 1925 году храм был передан в бессрочное пользование общине единоверцев. В 1936 году, после закрытия двух больших томских церквей, Никольской и Воскресенской, в Троицком храме стал служить епископ Томский Серафим. Троицкий храм ненадолго стал кафедральным собором города Томска. Единоверческая община воспротивилась этому: храм был перегорожен, и в одной половине шли епископские службы, в другой — собственные богослужения единоверцев.
В 1937 году епископ Серафим был арестован и расстрелян на Каштачной горе (томский аналог Бутовского полигона). Во время ареста епископа в храме комсомольцы учинили погром — сожгли множество икон, богослужебных книг и церковных облачений. Храм был закрыт.
До 1945 года храм переходил из рук в руки разных владельцев. За это время он очень пострадал — были разрушены деревянные части внутреннего убранства, утрачены оставшиеся иконы. В 1946 году храм открылся вновь и с тех пор больше не закрывался.